1885년 언더우드 선교사는 일본 요코하마를 거쳐 우리나라 제물포항에 도착,이틀을 지낸 뒤 포크 주한 미국 대리공사의 안내를 받으며 서울로 향했다. 서울에서 앨런 의료선교사의 사역장인 광혜원의 과학교사로 활동을 시작했다. 언더우드는 틈나는 대로 한글을 공부했다. 아펜젤러가 배재학당을 개교한데 이어 그는 1886년 길거리에 버려진 아이들을 중심으로 ‘예수교학당’을 열었다. 예수학당은 훗날 경신학교(현 경신중고등학교)로 이름을 바꿨다.
언더우드는 1887년 서울 정동장로교회(현 새문안교회)를 세운데 이어 경기도 양주군 양평군 김포군 시흥군 등지에 교회를 설립했다. 1912년 언더우드는 연희전문학교 설립을 위해 모금차 미국으로 떠나갔다. 몸이 많이 쇠약해졌지만 미 북장로교회 해외선교부를 방문,대학 건립의 당위성을 역설했다. 5만2000달러를 후원받은 언더우드는 미 남·북감리교회 서울 주재 선교사들과 캐나다 장로교회 선교부 등의 지원까지 받을 수 있었다. 1915년 3월5일 학생 60명과 교직원 18명으로 경신학당 대학부(현 연세대)는 시작됐다.
언더우드의 기도문
이 기도문은 언더우드 선교사님이 조선땅을 처음 밟으면서 하나님께 올린 기도입니다.
오 주여, 지금은 아무 것도 보이지 않습니다.
주님. 메마르고 가난한 땅,나무 한 그루 시원하게 자라오르지 못하고 있는 땅에
저희들을 옮겨와 앉히셨습니다.
그 넓은 태평양을 어떻게 건너왔는지
그 사실이 기적입니다.
주께서 붙잡아 뚝 떨어뜨려 놓으신 듯한 이곳,
지금은 아무 것도 보이지 않습니다.
보이는 것은 고집스럽게 얼룩진 어둠뿐입니다.
어둠과 가난한 인습에 묶여 있는 조선 사람들뿐입니다.
그들은 왜 묶여 있는지도, 고통이라는 것도 모르고 있습니다.
고통을 고통인 줄 모르는 자에게 고통을 벗겨주겠다고 하면
의심부터 하고 화부터 냅니다.
조선 남자들의 속셈이 보이지 않습니다.
이 나라의 조정의 내심도 보이지 않습니다.
가마를 타고 다니는
여자들을 영영 볼 기회가 없으면 어찌하나 합니다.
조선의 마음이 보이질 않습니다.
그러나 주님, 순종하겠습니다.
겸손하게 순종할 때 주께서 일을 시작하시고
그 하시는 일을 우리들의 영적인 눈이 볼수 있는 날이 있을 줄 믿나이다.
‘믿음은 바라는 것들의 실상이요 보지 못하는 것들의 증거니“라고 하신 말씀을 따라 조선의 믿음의 앞날을 볼 수 있게 될 것을 믿습니다.
지금은 우리가 황무지에 맨손으로 서 있는 것 같사오나,
지금은 우리가 서양귀신 양귀자라고 손가락질 받고 있사오나
저들이 우리 영혼과 하나인 것을 깨닫고, 하늘나라의 한 백성 한 자녀임을 알고
눈물로 기뻐할 날이 있음을 믿나이다.
지금은 예배드릴 예배당도 없고
그저 경계와 의심과 멸시와 천대함이 가득한 곳이지만 이곳이 머지 않아 은총의 땅이
되리라는 것을 믿습니다.
주여 오직 제 믿음을 붙잡아 주소서.
대한예수교 장로회 창문교회(WINDOW CHURCH)
